Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms