Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms