Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ldb3Q9JKS4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ldb3Q9JKS4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms