Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod2Q9JKK7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmod2Q9JKK7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmod2Q9JKK7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmod2Q9JKK7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmod2Q9JKK7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmod2Q9JKK7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Tmod2Q9JKK7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Tmod2Q9JKK7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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