Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trem1Q9JKE2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms