Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmg1Q9JK23 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmg1Q9JK23 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms