Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctnnbip1Q9JJN6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctnnbip1Q9JJN6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms