Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tulp4Q9JIL5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tulp4Q9JIL5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms