Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpgrip1Q9EPQ2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms