Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syde1Q9DBZ9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms