Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms