Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo2Q9D8S4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rexo2Q9D8S4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms