Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nsmce1Q9D720 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms