Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra4Q9D6F4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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