Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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