Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms