Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph14Q9D3W1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms