Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt20Q9D312 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms