Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl28Q9D1B9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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