Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Susd3Q9D176 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms