Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem53Q9D0Z3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms