Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms