Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thumpd2Q9CZB3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms