Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms