Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx7Q9CY18 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms