Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmd8Q9CX56 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms