Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms