Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms