Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp13a2Q9CTG6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms