Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ska2Q9CR46 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms