Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mri1Q9CQT1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mri1Q9CQT1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms