Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms