Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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