Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms