Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ska1Q9CPV1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms