Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms