Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrrtQ99MR6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms