Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms