Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprtQ99M80 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms