Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms