Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp1b1Q99LU0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp1b1Q99LU0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms