Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nmd3Q99L48 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nmd3Q99L48 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms