Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SptssbQ925E8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms