Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubb6Q922F4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms