Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SncbQ91ZZ3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms