Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms