Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rprd1aQ8VDS4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rprd1aQ8VDS4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms