Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CipcQ8R0W1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CipcQ8R0W1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms