Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otud6bQ8K2H2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms