Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brd3Q8K2F0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brd3Q8K2F0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms